Предположим, что оба проекта должны ссылаться на сборку в каталоге, отличном от bin. Предложите вам создать папку lib вне обоих решений, где оба могут ссылаться на эту сборку.
Корень вашей проблемы в том, что Instance1 хочет построить и перезаписать .dll в bin, но не может, так как Instance2 его блокирует.
Используя предложенный выше метод, ваша ссылка будет на статическое местоположение, которое не изменяется.