Вы можете просто отключить экспорт метаданных (удалить serviceMetadataBehavior или установить для его флага httpGetEnabled значение false), а затем поместить документ WSDL по URL-адресу, который имеет смысл для вашего приложения (? Wsdl - это соглашение WCF / ASMX, но не стандартное )
Это довольно легко, если вы используете хостинг IIS, но для самостоятельного хостинга потребуется конечная точка REST