Какие конкретные элементы управления вы имеете в виду? Те, что вы найдете в SharePoint Designer?
Если вы ссылаетесь на веб-части в WSS v3, те, которые используют веб-часть ASP.NET в качестве базовой веб-части (рекомендуемый подход), могут нормально работать в ASP.NET, поскольку класс веб-частей наследуется от Panel, которая наследуется от Web Control (здесь происходит из памяти) - все классы ASP.Net. Это будет зависеть только от того, имеет ли веб-часть какой-либо специфичный для SharePoint код, который сильно зависит от веб-части.