Массивы Numpy имеют фиксированный размер, поэтому вы не можете просто удалить элемент из них. Самый простой способ достичь желаемого - использовать нарезку:
a = a[3:]
Это создаст новый массив, начиная с 4-го элемента исходного массива.
Для определенных сценариев нарезки просто недостаточно. Если вы хотите создать подмассив, состоящий из определенных элементов из исходного массива, вы можете использовать другой массив для выбора индексов:
>>> a = arange(10, 20)
>>> a[[1, 4, 5]]
array([11, 14, 15])
Таким образом, в принципе, a[[1,4,5]]
вернет массив, состоящий из элементов 1,4 и 5 исходного массива.