ОК, никто не отвечает на мой вопрос после того, как я опубликовал его в течение почти 1 часа, что довольно необычно, но я только что нашел решение. Надеюсь, что это поможет другим, кто запутался в этом вопросе.
mail.IsRead=true;
mail.Update(ConflictResolutionMode.AutoResolve);
Вот и все. Ключ в том, что вы должны обновить элемент или EmailMessage после установки свойства IsRead.