Если вы ссылаетесь на файл css с главной страницы, вы должны убедиться, что он имеет абсолютный путь, чтобы он работал везде. Например:
<head runat="server">
<link type="text/css" rel="stylesheet" href="~/_styles/mystylesheet.css" />
</head>
Здесь важно отметить, что тег head имеет атрибут runar = "server", и я указываю полный виртуальный путь с использованием тильды ("~").