Похоже, что весь текст в сегментах был снова закодирован в UTF-8, даже если текст уже был в UTF-8.
В настоящее время я решил эту проблему, заменив строку 203 в Segment.php из odtphp следующим кодом:
return $this->setVars($meth, $args[0], false, 'UTF-8');