Вы можете создать дополнительное поле (уникальный идентифицированный тип) в своей пользовательской таблице и связать его с таблицей пользователей членства.
создайте нового пользователя, в случае успеха получите идентификатор нового созданного пользователя и вставьте его в свою пользовательскую таблицу.
MembershipUser mUser= Membership.GetUser(username);
Guid myId = (Guid)mUser.ProviderUserKey;
... Вставьте мой / id в вашу пользовательскую таблицу.