В DataMapper Identity Map действует только в рамках блока репозитория. Внутри этого блока вы можете сделать:
model.repository.identity_map(model).clear
ММ определяется моделью, поэтому невозможно найти все ММ для всех моделей за один звонок; вам, по сути, придется перебирать IM каждой модели и очищать их по одному.
Имейте в виду, что это не является частью документированного API, поэтому может быть изменено в будущих версиях DM. Однако (если говорить как сопровождающий DataMapper) он вряд ли изменится в серии 1.x, но, скорее всего, изменится для 2.x