Вы должны быть более конкретным, если я не дал вам правильный ответ, но из того, что я понимаю, вы хотите знать, что должны решить URL-адреса.
Что касается DNS, то оба www.domain.com и domain.com являются записью A (ip) для вашего веб-сервера.
Внутри вашего веб-сервера и www.domain.com, и domain.com должны ссылаться на один и тот же (корневой) каталог вашего сайта..
Так же, как у меня: DNS-сервер: www.domain.com и domain.com -Resolve To- xxx.xxx.42.53
WEB-сервер: www.domain.com и домен.com -Resolve To- / var / www / domain /
Так управляет большинство сайтов