Если вы действительно хотите использовать gcc 4.6 и 4.4 в своем затмении, вам придется скорректировать конфигурацию сборки (насколько я знаю, по умолчанию не существует "простого" способа сделать это).
Project -> Properties -> C / C +++ Build -> Manage Configurations -> create new
После того, как это будет создано (и выбрано), вы устанавливаете его так же, как и другие конфигурации в дереве (Debug / Release)).
new_configuration> Discovery -> команда вызова компилятора -> установить путь к gcc 4.6
Я считаю, что вы должны сделать это для каждого проекта, Eclipse неаккуратныйв этой области.