Возможно, я не правильно читаю ваш вопрос, но, судя по его звучанию, контент уничтожается и создается с новым выбором элементов, так?
Если это так, вам нужно будет вызвать tb_init ('. Some-selector') при загрузке нового контента. Я вспоминаю, что нужно было сделать это для условной настройки толстой коробки один раз. Thickbox работает, просматривая вашу страницу и связывая события кликов, чтобы связать их с классом «Thickbox». Используя tb_init (), вы можете в любое время подключить свои материалы к любому селектору, который вам нравится. Проверьте исходный код для Thickbox, чтобы понять, что я имею в виду.