MasterPages и шаблоны сайтов - это абсолютно разные вещи. Главной страницей обычно является макет некоторых страниц. Это так же, как в ASP.NET.
В Sharepoint вы можете создавать несколько сайтов в семействе сайтов. Эти сайты создаются в соответствии с шаблоном сайта. При создании (например) сайта группы он создается в соответствии с шаблоном сайта группы, который хранится в папке Sharepoint в файловой системе. В шаблонах сайта вы можете указать, какие функции должны быть активированы при создании сайта, какие функции должны быть активированы в области семейства сайтов и т. Д. Также вы можете указать список, который должен быть создан, модули ... А также вы можете указать главную страницу по умолчанию который будет использоваться на сайте.
Вы можете найти больше информации на msdn