Насколько я знаю, вы не можете комбинировать стандартный SQL и активную запись, как пытаетесь это сделать.
Однако вы можете написать строку WHERE вручную, если хотите, и затем передать ее в класс ActiveRecord. Я не совсем уверен, что это то, что вы ищете, потому что я никогда не использовал CASE, но похоже, что это то, что вы ищете? Дайте мне знать!
$where = "name='Joe' AND status='boss' OR status='active'";
$this->db->where($where);