Опуская префикс --install или --prefix, вы оставляете настройки по умолчанию для приложения.Если у вас есть другая структура для вашей файловой системы, с точки зрения расположения каталогов и т. Д., То это то место, где вы бы изменили ее.Такая программа, как Apache или PHP, позволяет увидеть все различные параметры:
./configure --help
В первом разделе справки будут показаны различные доступные параметры.
Если вам не нужно менять его или у вас нет желания устанавливать его во временный каталог для тестирования и у вас нет проблем с перезаписью, которые могут существовать, оставьте префикс установки по умолчанию или сообщение на https://unix.stackexchange.com/