Может быть, движок рендеринга браузера не позволит Flash быть частью прозрачности? Или, может быть, наложение не совсем прозрачно? Просто область вокруг наложения не отображается или вы не можете видеть сквозь наложение до вспышки, где она должна быть частично прозрачной?
Мне кажется, что если у вас непрозрачный (gif или jpeg), то даже если вы установите прозрачный элемент, он может не очень хорошо работать со flash. Может быть, попытаться сделать изображение .png, которое уже прозрачно, без каких-либо стилей HTML / CSS?
Несмотря на то, что приходит мысль, если у вас уже есть в основном вспышка, почему бы не сделать наложения также и во вспышке? Это было бы возможно более функционально и имело бы больше возможностей для настройки.