Вы можете прикрепить средство записи журнала к провайдеру как-то так
var provider = ProviderFactory.GetProvider("ApplicationServices");
var writer = new StreamWriter(
File.Open(@"c:\temp\sqlqueries.txt", FileMode.Append, FileAccess.Write, FileShare.ReadWrite)
);
provider.Log = writer;
return new SimpleRepository(provider, SimpleRepositoryOptions.RunMigrations);