Вы говорите о работе с приложением, которое полностью находится за пределами домена приложения?Если это так, вам придется войти в Win32 API.Хорошее место для начала - pinvoke .
Или вы хотите сказать, что вы хотите, чтобы ваше приложение позволяло вам продолжать делать что-то, пока оно выполняет тяжелую работу в другом процессе?В этом случае посмотрите на тему BackgroundWorker .
Не зная, что вы подразумеваете под «другими вещами» и «пока все это происходит», трудно дать вам точный ответ.