Я бы порекомендовал создать собственную библиотеку с собственным пространством имен.Переместите все модели для вашего «основного проекта» в папку моделей в этой библиотеке.Затем добавьте модели в ваш основной проект, а новый проект расширит модели в этой библиотеке.Вы можете поддерживать эту библиотеку в репозитории SVN и включать ее в оба проекта как внешние.
Таким образом, ваша структура каталогов может выглядеть примерно так:
htdocs
library
My
Model
Modelname
application
models
Modelname
Тогда ваша модель будет выглядеть примерно таквот так
class Model_Modelname extends My_Model_Modelname {}
Надеюсь, это направит вас в правильном направлении!