В вашем локальном apache VirtualHost добавьте эту инструкцию:
<Directory /my/directory/where/the/htaccess/is >
# prevent reads of .htaccess files
AllowOverride None
</Directory>
Тогда ваш локальный Apache никогда не будет читать .htaccess в этом каталоге (и его подкаталогах)