Пересечение файлового дерева Java и системы упаковки Apple снова поражает!
Я только что решил что-то похожее на это (я думаю, что наследие неудачного бета-обновления). Та же ошибка, по крайней мере. Ситуация, которую я обнаружил на моем диске, заключалась в том, что в моей установке JDK были символические ссылки вместо реальных файлов (включая cacerts):
> ls -lt /Library/Java/JavaVirtualMachines/1.6.0_30-b12-404.jdk/Contents/Home/lib/security/
total 24
lrwxr-xr-x 1 root admin 79 Apr 7 15:11 blacklist -> /System/Library/Java/Support/Deploy.bundle/Contents/Home/lib/security/blacklist
lrwxr-xr-x 1 root admin 81 Apr 7 15:11 cacerts -> /System/Library/Java/Support/CoreDeploy.bundle/Contents/Home/lib/security/cacerts
lrwxr-xr-x 1 root admin 87 Apr 7 15:11 trusted.libraries -> /System/Library/Java/Support/Deploy.bundle/Contents/Home/lib/security/trusted.libraries
К сожалению, связанных Deploy.bundles не существует.
В моем случае я смог вернуться в Time Machine, найти удаленные пакеты и восстановить их.
Возможно, у вас уже есть некоторые старые версии, на которые вы можете сослаться. По крайней мере, вы сможете посмотреть, есть ли у вас похожая проблема.
Извините, это не полное решение, но я надеюсь, что оно продвинет вас немного дальше.
Вы всегда можете просто получить дистрибутив от Oracle и вставить файлы сертификата на место, хотя, если в вашей установке отсутствуют другие элементы, могут возникнуть другие проблемы.
В Google я нашел этот блог:
http://architecturalatrocities.com/post/19073788679/fixing-the-trustanchors-problem-when-running-openjdk-7
Проблема в том, что openjdk не включает файлы, и он рекомендует создать ссылку на файл Bundle, который мне пришлось восстановить в моем случае.