Я использую Jruby.
Я избавился от этого предупреждения, добавив пустой файл с именем 'thrift_native.rb' в каталог в моем $ LOAD_PATH, который имеет приоритет над папкой thrift.
Я решил просто добавить его в тот же каталог 'app-root', в котором хранится мой Gemfile.