Да, и многие люди (включая меня) делают это постоянно.Вы не можете связать их обоих на одном и том же порту.Tomcat обычно прослушивает http-порт 8080, который вы можете прокси через apache до 80, используя mod_proxy.Другой способ - не использовать http для tomcat, а включить протокол AJP, который вы выставите через mod_jk на порт 80 апача.