Свободный NHibernate поддерживает автоматических сопоставлений , стандартных отображений xhibernate xml (hbm) и, конечно, Свободных сопоставлений стиля Вы можете смешивать и сопоставлять любое из этих сопоставлений с помощью Fluent NHibernate.
Fluent не поддерживает новое отображение по коду , введенное в версии 3.2 (они действительно разные животные) NHibernate, но я не уверен, что это действительно проблема. Лично я бы порекомендовал использовать Fluent на этом этапе, потому что документации намного больше, а пользовательская база больше, чем отображение по коду .
Свободный NHibernate довольно прост в использовании и определенно имеет свои преимущества перед сопоставлениями в стиле XML (hbm). Вы можете прочитать об этом больше на Свободно Вики