Забудьте про дерьмовую генерацию, начните с последней версии EF и используйте сначала подход кода. После этого вы полностью контролируете POCO. Я все еще немного разочарован в EF, но подход, основанный на коде, позволит вам создавать классы так, как вам нравится, и затем связывать их с битами ORM. Если вы не хотите писать свои собственные классы, я не знаю ни одного способа добиться того, чего вы хотите.