Когда я обновил инструменты SDK до версии 10, все мои проекты начали терпеть неудачу.
Очевидно, что при очистке сборки будет удалена папка gen, и сборка не удастся из-за отсутствия R.java.
Это также происходит со сборкой, которую eclipse делает при запуске, поэтому, если вы закроете eclipse со всеми своими проектами в порядке, при повторном запуске eclipse проекты потерпят неудачу.