Вы перемещаете положение отображаемого объекта, изменяя его верхнее и левое поля, которые вместе являются координатами его верхнего левого угла. Если вы знаете абсолютные координаты целевой позиции, вы можете изменить поля, и объект переместится в это место.
Если вы не знаете абсолютную целевую позицию, но знаете только две относительные дельты (т.е. переместите окно на 5 пикселей вверх и вправо на 10 пикселей), вы можете прочитать верхний и левый поля объекта, увеличивая их на соответствующие расстояния и установите поля от этого.
Поля являются частью стиля объекта, так что вы бы сказали что-то вроде:
theobject.style.left = 10 + 'px';
theobject.style.top = 40 + 'px';
для позиционируемого объекта.