В вашей версии mpich2 рекомендуется использовать mpiexec вместо mpirun.
Чтобы запустить приложение, вы должны написать машинный файл со следующим синтаксисом:
machine1[:number of cores]
...
machinen[:number of cores]
Одна строкадля каждой машины с необязательным числом ядер, которому предшествует двоеточие, например:
node0:2
node1:3
Затем вы вызываете свое приложение так:
mpiexec -f machinefile -n <number of processes> yourapplication
Попробуйте и скажите нам, что выполучить.
Помните, что в конфигурации по умолчанию mpich2 требует конфигурации ssh без входа в систему для запуска процессов.