Я работаю в Text Mining со статьями от Medline.Я проиндексировал все Medline2011 с MongoDB (http://www.mongodb.org/),, теперь я могу получить одну статью с ее PubMedID. Я хочу объединить ее с UIMA (http://uima.apache.org/),), и я создал DescriptorReader для получения статьи String из MongoDB (используя драйвер MondoDB для JAVAУ меня есть этот код (быстрый пример), и он работает:
public static void main(String[] args) throws UnknownHostException, MongoException {
Mongo m = new Mongo("localhost", 27017);
DB db = m.getDB(DB_NAME);
DBCollection coll = db.getCollection(COLLECTION_NAME);
BasicDBObject query = new BasicDBObject();
String pmid = "6889938";
query.put("_id", pmid);
DBObject myDoc = coll.findOne(query);
System.out.println(myDoc);
}
Но, когда я пытаюсь написать тот же код в проекте с UIMA, у меня появляется следующая ошибка:
КогдаЯ использую:
private String getAbstractXMLFromMongoDB(String pmid) throws UnknownHostException, MongoException{
Mongo m = new Mongo(); // <-----ERROR
...
return "something"
Ошибка в консоли:
ThreadGroup.uncaughtException()-Got Error
java.lang.NoClassDefFoundError: com/mongodb/Mongo
...
А если я использую try / catch:
private String getAbstractXMLFromMongoDB(String pmid){
try {
Mongo m = new Mongo(); // <-----ERROR
...
} catch (UnknownHostException e) {
e.printStackTrace();
} catch (MongoException e) {
e.printStackTrace();
}
return "something"
Ошибка в консоли:
Exception in thread "Thread-5" java.lang.NoClassDefFoundError: com/mongodb/MongoException
at java.lang.Class.forName0(Native Method)
at java.lang.Class.forName(Class.java:247)
...
Я попытался (в примере кода) получить доступ к MongoDB с 100 потоками одновременно и работает ... Я не знаю и не предпринимаю того, что происходит ...
Есть предложения?
thx.