Копирование папки Eclipse должно работать.Попробуйте.
Сказав, что, когда я нахожусь в той же ситуации, я обычно просто переустанавливаю Eclipse - это не займет много времени, если у вас быстрое сетевое соединение, и это хорошая возможностьчистая установка со всеми последними версиями плагинов.