Кнопки отключены только для этой программы или для всех программ?
Я смутно помню, что у меня была похожая проблема много лет назад. Я думаю, что воссоздание проекта и файлов решения исправило это (т.е. создайте новое решение / проект и импортируйте все файлы .vb).
Еще одна вещь, которую нужно проверить, это то, стали ли скомпилированные файлы доступными только для чтения. Может быть, VB.NET не может удалить старые .EXEs