Как уже говорили другие, ваш компьютер, вероятно, все еще загружает другие приложения в течение первых нескольких минут после загрузки. Ваш жесткий диск (один из самых медленных компонентов) занят попытками загрузить эти другие приложения и соответствующие им данные.
Если у вас есть второй диск на вашем компьютере, попробуйте установить приложение на второй диск. Если второй диск обычно простаивает в это время, я думаю, что приложение запустится гораздо быстрее.