Я предпочитаю использовать шаблоны, чем использовать клон. Смотрите мой ДЕМО здесь,
Ниже функция addRow добавит новую строку в таблицу.
var rowTmpl = '<tr>' +
'<td><input type="text" id="A{ID}" name="A" value=""></td>' +
'<td><input type="text" id="B{ID}" name="B" value=""></td>' +
'<td><input type="text" id="C{ID}" name="C" readonly="readonly" tabIndex="-1" value=""></td>' +
'</tr>';
function addRow () {
var rowCount = $('#math-table tbody tr').length;
//modify template
var addRow = rowTmpl.replace (/{ID}/g, rowCount);
//append to the tbody
$('#math-table tbody').append(addRow);
}