Можете ли вы по-прежнему объединять свою HEAD с пультом дистанционного управления, не удаляя при этом полностью изменения, но всегда разрешая конфликты в пользу удаленного:
git pull -s recursive -Xtheirs <remote-ref>
Но будьте осторожны - ваши изменения будут частично сохранены,и частично перезаписано.Это может быть нормально, если вы ожидаете, что они будут перезаписаны в одной части дерева и сохранены в другой, но будьте очень осторожны с полученным кодом, обязательно просмотрите его и сравните с удаленной версией.