Нет. Если вы измените атрибут src фрейма на about: blank, содержимое этого фрейма будет заменено пустым документом, и любой javascript, работающий внутри iframe, прекратит работу.
Если вам нужен способ связи между двумя, один из способов - это предоставить какую-то конечную точку на основе JSON, которую можно вызвать из одного из доменов, в то время как другой опрашивает результат.
UPD : Что касается вашего вопроса, я думаю, они не используют iframe. Pronto - это букмарклет, позволяющий запускать код на «внешней» странице. Хотя я не проверял это, я бы предположил, что они могут заставить страницу браузера загружать свою библиотеку JS через вставленный элемент скрипта и таким образом отображать свой интерфейс.