С Neo4j вы можете использовать язык запросов Cypher для выражения таких специальных запросов, либо со встроенной консоли инструмента web-admin, через встроенную Java, JRuby или Python-API или через удаленный REST-API с драйверами на многих языках.
Некоторые примеры:
start p=node:types(type='person') where p.age > 20 and p.age < 30 return p
start p=node:node_auto_index("id:*") where p.name =~ /Se.*/ return p
start p=node(0) match r-[:TAG]->tag where tag.name = 'funny' or tag.name = 'adorable' return tag