В ответ на mopoke, для IE6 вы определенно хотите использовать Visual Studio для отладки, если можете его получить. По сути, отладчик сценариев MS бесполезен. Вам лучше использовать некоторую форму трассировки (не оповещения), чем отладчик сценариев MS. Например, Dojo Toolkit предоставляет консоль отладки для трассировки, но вы можете написать свою собственную, выгрузив сообщения во вторичное окно или div.
Отладчик сценариев без необходимости запрашивает каждую ошибку в IE6 и даже тогда не дает достаточно контекста состояния, чтобы сделать его полезным в достаточно сложном приложении JS. Visual Studio более тесно интегрирована и более дружелюбна. Просто мой опыт.