Расширения файлов мало что значат.Веб-сервер настроен на что-то с определенными расширениями, но на самом деле это может быть что угодно.У него нет никаких последствий для безопасности, и что касается браузера, то это просто название.
Я создал различные приложения, использующие уникальные расширения ... например, веб-приложение на C # .NET, в котором было два: .portal был для запросов веб-страниц, а .taj был для запросов ajax.
Кому-то просто нравится .php, я думаю.
Что касается мобильного сайта jQuery, похожепросто хочу, чтобы вы построили его с помощью PHP (и он не должен быть предназначен для PhoneGap.)