Первым шагом будет добавление пакета реестра eclipse к начальным артефактам для пользовательского региона; в org.eclipse.virgo.kernel.userregion.properties измените исходные артефакты на:
initialArtifacts=repository:plan/org.eclipse.virgo.kernel.userregion.blueprint,repository:plan
/org.eclipse.virgo.web.tomcat,repository:configuration/org.eclipse.virgo.apps.repository,repository:plan/org.eclipse.virgo.management,repository:bundle/org.eclipse.equinox.registry
Это как минимум обеспечит доступность плагина реестра во время загрузки ваших плагинов eclipse.
То, с чем я все еще борюсь, это выяснить, как контролировать, какой plugin.xml загружается реестром и что вызывает это. Каким-то образом некоторое время выполнения затмения будет сканировать каталог некоторых плагинов, но как мне установить его в Деве, пока неясно.