Если вы посмотрите на вопрос в своем комментарии ссылка , есть ответ (вики сообщества Ribo), предоставляющий фрагмент кода на Java для декодирования манифеста XML в APK, а затем воссоздание XML.
Предоставляя файл APK, код извлекает манифест и создает его заново.
Я просто очень быстро прочитал код и не нашел ничего связанного с Android (т.е. чистой Java). Поэтому я считаю, что вы можете скопировать этот код и создать автономный Java-jar, который будет выполняться по требованию. Или встроенный в код, если вы хотите пойти дальше.