Перейдите в корневой каталог вашего исходного дерева и выполните следующую команду:
$ make modules SUBDIRS=drivers/the_module_directory
И для установки скомпилированного модуля:
$ make modules_install SUBDIRS=drivers/the_module_directory
Примечание: Как упоминает lunakid, последняя команда может не сначала собирать модуль, поэтому будьте осторожны.