как визуализировать 200 тыс. строк и 100 столбцов данных

Question

heatmap и pheatmap of R не смогли создать кластер из-за этой ошибки.

Error in vector("double", length) : vector size specified is too large

Кто-нибудь знает, как я могу визуализировать эту большую матрицу?

Answer 1

Пакет hexbin предназначен для эффективного суммирования двухмерных дисплеев с большим количеством. Только с более чем десятью миллионами очков это несколько замедляет мой 3-летний Mac. (Честно, @James, я думал об этом самостоятельно.) Это небольшой мод к примеру на одной из его страниц справки:

 require(hexbin)
 h <- hexbin(rnorm(10000),rnorm(10000))
  plot(h, colramp= function(n){magent(n,beg=15,end=225)})