Можно ли реализовать приложение, которое программно защищает доступ к "настройкам" телефона с помощью пароля?
Ответ для вас может лежать в API администрирования устройства для Android
Также см. Пример http://developer.android.com/resources/samples/ApiDemos/src/com/example/android/apis/app/DeviceAdminSample.html