Учитывая, что вы используете JNA для общения с OpenCV, что, вероятно, подразумевает для меня, что OpenCV - это нечто родное и, возможно, даже не подозревающее о java.Следующий вопрос - у него нет java API, почему он пытается печатать сообщения, используя System.out?Вероятно, он вызывает операционную систему точно так же, как это делает стандартный System.out для вывода текста на консоль.