MPI_Allgather дает противоречивые результаты - PullRequest
Новая
       25

MPI_Allgather дает противоречивые результаты

0 голосов
/ 09 декабря 2011

У меня проблемы с MPI_Allgather в части большого программного обеспечения.

Следующая функция получает двойной и связанный флаг, который отличается на каждом узле, затем предполагается, что функция найдет глобально минимальный двойной и установит все узлы на соответствующие значения. 

void set_dt_to_global_min (double *dt, int *flag) {
    int ierr, size;
    ierr = MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);

    if (size == 1)
        return;

    typedef struct DT_FLAG_ {
        double dt;
        int flag;
    } DT_FLAG;

    DT_FLAG local;
    DT_FLAG *gathered = (DT_FLAG *) malloc(size * sizeof(*gathered));

    local.dt = *dt;
    local.flag = *flag;

    MPI_Allgather(&local, sizeof(DT_FLAG), MPI_BYTE, gathered, sizeof(DT_FLAG), MPI_BYTE, MPI_COMM_WORLD);

    int i, imin;
    for (imin = 0, i = 1; i < size; ++i) {
        if (gathered[imin].dt > gathered[i].dt) {
            imin = i;
        }
    }

    *dt = gathered[imin].dt;
    *flag = gathered[imin].flag;

    free(gathered);
}

Я выполняю это на 6 узлах в настоящее время и обнаружил, что следующая ошибка возникает только на Узле 5 (который имеет наименьшее значение dt):

  • истинное значениеgathered[0] заменяется на gathered[2]
  • истинное значение gathered[1] заменяется на gathered[3]

Я подумал, что, возможно, это как-то связано с MPI_COMM_WORLD какпотенциально существует вызов MPI_Comm_Split ();однако, пока, я не понимаю эту часть кода.

У кого-нибудь есть идеи?

- РЕДАКТИРОВАТЬ: Обновлен вопрос, чтобы отразить, что нам действительно нужно удерживать флаг, который также связан с dt - это означает @suszterpattпредложение отлично подходит для моего первоначального вопроса, но на самом деле не подойдет (я не думаю) для этого.

1 Ответ

0 голосов
/ 26 января 2012

Недавнее обновление до mpi-default-dev, похоже, решило проблему - я опубликую более подробную информацию, когда смогу выяснить, какие изменения могли бы это исправить.

...