Я столкнулся с подобной проблемой, но в моем случае я анимировал только ось X фона, используя что-то вроде "backgroundPosition: '+ = 1350px 0px'", по какой-то причине это перестало работать, когда я перешел на jQuery 1.6 .2 ... Все мои другие анимационные экземпляры работали нормально, в том же блоке.
В конце (после долгого сеанса отладки) я заметил, что если я удалил значение Y-оси из вызова, это сработало. поэтому "backgroundPosition: '+ = 1350px 0px'" больше не работает, но работает "backgroundPosition: '+ = 1350px'". Странно то, что он даже не выдает ошибку, анимация обрабатывает, но ничего не происходит (так что ошибки нет). На данный момент я не могу придумать, как анимировать фоновое изображение на оси Y.