Да - на самом деле это единственный способ сделать это.(Lucene не может генерировать идентификаторы для вас. То, что она называет «идентификаторами документов», является только внутренним и может изменяться по прихоти Lucene.)
У вас просто будет поле с именем «myID» или что-то ещеи пометить его как сохраненный.