Чтобы завершить ответ McDowel, существует также ошибка , связанная с тем, как Linux проверяет наличие метки упаковки:

Исправлено с 3.4M7.
Даже если это не относится к вашему случаю, было бы полезно узнать, какую версию Eclipse вы используете, и можете ли вы воспроизвести ошибку с последними (например, 3.5M6)