Да, вам нужно включить все ссылки на синхронизацию DLL. У меня есть база данных SQL 2008, синхронизирующаяся с клиентами Compact 3.5, для этой установки. Пропустите предварительные условия развертывания проекта и перейдите к файлам приложения в свойствах проекта развертывания.
и включают в себя:
Microsoft.Synchronization
Microsoft.Synchronization.Data
Microsoft.Synchronization.Data.SqlServerCe
Если вы не используете SqlServerCe, включите соответствующую DLL. Я думаю, что если вы используете sqlexpress, вам необходимо добавить это в качестве предварительного условия.