Если вы хотите сделать это в eclipse и в командной строке, я бы отредактировал make-файл, добавив цели в зависимости от элементов.Make при необходимости определит порядок.
Если все в порядке, если эта работа выполняется только в проекте Eclipse, то добавьте настраиваемую цель make. В представлении «Make Target» нажмите «Create a Target», снимите«То же, что и имя цели».Перечислите все несколько зависимостей в окне редактирования «make target».